Adobe Acrobat - duda proceso por lotes

Hola a todos, el problema que tengo es el siguiente, tengo algo asi como 180 directorios y dentro de cada uno entre 7 y 10 ficheros que tengo que pasar a pdf, cuando lanzo un proceso por lotes lo que me hace es crear un pdf por cada archivo contenido en el directorio (osea que me genera entre 7 y 10 pdf por directorio), mi pregunta es la siguiente ¿se puede hacer que se genere un unico fichero pdf por directorio? ¿alguien ha tenido que hacer algo parecido alguna vez?

Gracias, me ahorrariais un monton de trabajo