Hola otra vez Ildefonso.
Mira, eso de las unidades no tiene nada que ver, al menos nada que ver para que se "equivoque" Autocad.
El que trabajes en milimetros o en pulgadas no tiene nada que ver para que consigas imprimir lo que quieres al tamaño que quieres.
Yo creo que estas trabajando con el sistema decimal, no lo has cambiado bien, ya que dices que al consultar una distancia, autocad hace lo que hace siempre que esta en decimal, darte las unidades y el angulo, pero sin reflejar ningun tipo de unidad tal que "345mm". Autocad coloca una coma ' o dos " cuando estas trabajando en pulgadas.
Dejando esto a parte, prueba lo siguiente. Dibuja un cuadrado de 100x100 unidades, ve a imprimir, selecciona tu impresora, selecciona como tamaño de papel A4, selecciona como area de trazado una ventana (supongo que no estes haciendo el trazado por extension, por limites o por pantalla) y selecciona el recuadro que acabas de dibujar, como escala de impresion pon 1:1 e imprimelo. Lo que te salga por la impresora, midelo con una regla a ver si es de 100x100.
Si es de 100x100, te estas equivocando en la escala que tu pones, o en el tamaño de papel o en las dos cosas, si no mide 100x100 postea lo que mide a ver que es lo que pasa.
Un saludo.