Buenas.
si no me equivoco tu quieres tener un banner que sera una imagen y encima de ella poner el logotipo de tú web.
Bien se puede hacer con photoshop como comentas pero existe una posibilidad más que es gracias al css y a la propiedad z-index.
Lo que haces con z-index es superponer las imagenes para que me entiendas.
ejemplo:
Necesitas usar la propiedad position ya que si no z-index no funcionara. Top y left es para situarlo puedes jugar con ellas y tambien puedes usar bottom y right. el valor de z-index va desde 0 que seria el que esta debajo hasta el infinito, normalmente para evitar errores yo uso grupos de 100 en 100 así me aseguro que no exista problema alguno.
De esta forma podras superponer una navegación, un slider, etc.
Espero que te quedara claro y puedas hacerlo
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