Java - Modificar fichero con java

Muy buenas a todos. Tengo unos ficheros que contienen enlaces del tipo <a href=""/>. La ruta de esos enlaces están con rutas absolutas y las tengo que poner como relativas. Tengo que crear una función que le paso la ruta principal, por ejemplo (dir1/dir2) y después, por cada / que me encuentre tengo que quitarlas y sustituirlas por ../.

Por ejemplo, si el fichero contiene un enlace como este (<a href="dir1/dir2/dir3/foto.jpg") y le paso a la función como ruta principal dir1/dir2() el fichero me tiene que quedar asi:

<a href="../foto.jpg"/>

Alguna idea de como meterle mano???

Muchas gracias.