Hola Yaicel:
Para eso, si no he entendido mal, lo único que tienes que hacer es asociar la extensión del archivo con tu aplicación. En Windows 7, sería tan fácil como pulsar con el botón derecho del ratón sobre el archivo, opción Abrir con..., opción Elegir programa predeterminado... y en el cuadro de diálogo que aparece pulsar en el botón Examinar... si tu aplicación no aparece por defecto en esta ventana.
Buscas tu aplicación, la seleccionas y te aseguras que está marcada la casilla donde pone Usar siempre el programa seleccionado para abrir este tipo de archivos.
En otros sistemas no Windows, esto cambiará, claro.
Si lo que quieres es que al instalar tu aplicación, automáticamente asocie el tipo de fichero con tu aplicación, tendrá que ser el instalador de la aplicación el que haga esta tarea de forma automática.
Espero que te sirva y si no te queda claro, por aquí seguimos.
Saludos,
José Manuel
===================
http://www.orbisapientia.com