JavaScript - comunicación java-javascript

hola a todo,

este es mi primer post y espero que me venga de ayuda.

me sale un fallo en esta linea

File fitxategia = new File("C:/Users/usanchez010/Desktop/naff/%>dokIzen<%");

donde el valor dokIzen es un parametro metido en la funcion javascript. la cosa es que estoi utilizando dentro de una funcion javascript codigo java. pero necesito meter este parametro dentro del String para poder leerme el documento.

el fallo que me devuelve es el siguiente:
Ha tenido lugar un error en la línea: 43 en el archivo jsp: /index.jsp
String literal is not properly closed by a double-quote

aqui os dejo parte del codigo x si os sirve de algo

39 function dokumentuaIrakurri(dokIzen){
40 alert("dokumentuaIrakurri");
41 <%
42 KAFDocument berria;
43 File fitxategia = new File("C:/Users/usanchez010/Desktop/naff/%>dokIzen<%");
44 berria= KAFDocument.createFromFile(fitxategia);
45 String testua, naf;
46 List<WF> wflista= berria.getWFs();