Matlab - cortar varios GEOTIFFs con una mascara shapefile en matlab

Hola, alguien me pueda ayudar, soy nuevo en el uso de matlab y en programar en general, vengo trabajando con varias imágenes SIG de cobertura vegetal de 184 meses, las tengo cargadas en matlab como una matriz de 3 dimensiones (tiempo, filas, columnas) , sin embargo las imagenes corresponden a un area bastante extenso y quisiera limitar mi trabajo a un área mas reducido. ¡Como aria en matlabr cortar todas las imágenes con una mascara shapefile shaperead(areadeestudio.shp). Podria ser poly2mask pero no se como utilizarlo con un shape.
Espero me pueda ayudar. Gracias

Omar.