En los manuales de la Web del Programador hay uno llamado "Manual de interfaz gráfica de usuario en Matlab" que tiene varios ejemplos que te servirán. En la página 29 hay un ejemplo de graficar en una GUI.
También hay un ejemplo en Matlab que se llama "GUI with axes and menu" entre las plantillas (templates) del GUIDE.
Para cambiar color puedes ver el help de Matlab acerca del comando plot. Por ejemplo, dado un vector x, se dibuja el seno de x en color verde:
plot(x, sin(x), 'g')
En rojo:
plot(x, sin(x), 'r')
El seno de x en rojo con asteriscos, y el coseno en verde con rombos y punteda:
plot(x, sin(x), 'r*', x, cos(x),'gd:')
El seno de x y el coseno de x con color aleatorio:
plot(x, sin(x), 'Color', [rand,rand,rand])
hold
plot(x, cos(x), 'Color', [rand,rand,rand])
Si vas a graficar los tres valores como líneas paralelas al eje x, primero debes definir un vector x.
x = 0:0.1:5;
plot(x, 0.322*ones(1, length(x)), 'r', x, 1.65*ones(1, length(x)), 'b', x, 0.1*ones(1, length(x)), 'g')
Si vas a graficar los tres valores como columnas paralelas al eje y:
stem([ 0.322, 1.65416, 0.1000], [1,1,1])
Pero en este caso no se puede cambiar el color individualmente.