Windows CE - Correr una aplicacion

Buenas tardes, una consulta, quiero correr una aplicación en C, cuando ocurra una acción especifica, es decir, un lector de código de barras lee un producto y guarda el código en un archivo, en ese momento quiero correr la aplicación, no quiero dejarla corriendo todo el dia, para no gastar recursos, como podria hacerlo, gracias, espero me ayuden