KB65 en Batch input fondo
El problema que mencionas podría deberse a diversos factores, por lo que sería necesario revisar con más detalle el código que estás utilizando para el batch input y cómo estás manejando los punteros en el mismo.
Respecto a una BAPI que pueda sustituir la transacción KB65, SAP proporciona una BAPI llamada BAPI_ACC_DOCUMENT_POST que permite la contabilización de documentos de contabilidad de forma programática. Esta BAPI se puede utilizar para crear o modificar documentos de contabilidad, y es posible que te ayude en la tarea que estás realizando. Sin embargo, es importante tener en cuenta que su uso requiere de un conocimiento previo de la estructura de los documentos de contabilidad de SAP.
Te recomiendo que revises el código de tu batch input y revises si estás manejando correctamente los punteros. También puedes revisar si existe alguna nota SAP que aborde este problema específico con la transacción KB65. En caso de que decidas utilizar la BAPI_ACC_DOCUMENT_POST, te sugiero que consultes la documentación de SAP sobre su uso y la estructura de los documentos de contabilidad.