Adobe Acrobat - mantener el orden de los marcadores

Hola a todos,
Tengo un problema al crear mi documento pdf. Al realizar un índice de mi trabajo escrito a través de marcadores con el adobe acrobat profesional 6.0 el orden de estos marcadores desaparece cuando cierro el documento y vuelvo a abrirlo. Es un desorden de marcadores que no sé como evitar. Por favor, alguien sabe cómo solucionar este problema?
Un saludo a todos