Clipper/FiveWin - rendimiento programas

Hola a todos , se me presenta el siguente problema . Una misma aplicación de clipper linkada con blinker7 en modo real va mas rapida en un disco USB externo que en el SATA interno, si desde el administrador de tareas visualizo los dos procesos NTVDM, observo que la aplicacion del disco USB consume de un 40 a 50 % de CPU mientras que la otra oscila entre un 5 y un 10%, por tanto supongo que la aplicación funciona mas lenta porque la CPU no le presta tanta atención. ¿Porque?, ya he probado a cambiar prioridades y no afecta a los consumos de CPU.

Gracias de antemano por vuestras respuestas