Bueno, tiene razón Diego, FAT32 es mejor. Pero te explico por qué:
* El numerito 16 ó 32 está dado por el número de bits que se usan para señalar un determinado sector del disco. En otras palabras, tenes tantos sectores como te permitan direccionar ese número de bits: 16 bits = 65535 sectores y 32 bits es eso al cuadrado (muuucho más).
* El problema de la FAT16 es el siguiente: es algo que era estándar hace años, cuando un disco no llegaba a más de 540 MB. A medida que se fué mejorando la tecnología, los discos se hicieron cada véz más grandes y, si te ponés a pensar en los discos como si fueran tortas, los pedazos de torta eran más grandes mientras más grande era el disco. Es decir, un sector en un disco de 540 MB era de 2KB (por decir algo) y ese mismo sector en un disco de 20GB era como de 1 MB!!!.
* ¿Por qué es esto un problema?, bueno archivos van tomando el espacio de a sectores completos, cuando se termina el espacio de un sector toma otro, pero ENTERO. No se pueden compartir sectores y cada archivo (lógicamente) ocupa por lo menos un sector. Ahora pensá que tenés un archivo de 1 KB y ocupa un sector de 1 MB; ¿es eso aprovechar el espacio?, claro que no!!!!. Quiere decir que con 10 archivitos de 1 KB estás ocupando en realidad 10 MB!!!, esto es tirar disco a la basura.
* LA SOLUCION es poder dividir el disco en sectores más chiquitos, lo que se logra aumentando el número de bits para direccionar sectores. Por eso es más eficiente FAT32 que FAT16.
¿Entendiste?, también te cuento que hay otras cosas como particiones, etc... que te permiten hacer un uso más eficiente del disco y en tu caso te convendría averiguar un poco más al respecto
