Para no variar, Netscape y Explorer tienen 2 sistemas diferentes para incrustar las fuentes. Así, Netscape utiliza tecnología de Bitstream, mientras que Explorer necesita un plugin para ver las fuentes insertadas con este sistema (y que van colocadas en un archivo *.pfr) y microsoft utiliza como sistema nativo un archivo *.eot para insertarlas.
Es un tema un poco largo de explicar: encontrarás un tutorial muy bueno y completo en WEBMONKEY:
http://hotwired.lycos.com/webmonkey/design/fonts/tutorials/tutorial2.html