Dreamweaver - linea de tiempo

Hola!
Soy bastante novato en esto de la paginas web. Utilizo la linea de tiempo con capas para que desaparezcan y aparezcan como yo quiera, y me va bien. Pero cuando meto un menu desplegable (que es un javascript) las capas ya no hacen lo que les indico en la linea de tiempo!
Por ejemplo si pongo que desaparezca un capa que al principio esta visible no me lo hace si tengo el menu desplegable.

gracias por adelantado