Pues pueden pasar tres cosas:
Si durante la instalación le das la opción R, te reinstala el S.O sin perder tu configuración y datos
Si haces la instalación desde cero, te dice que especifiques una carpeta donde va a mover tus datos actuales para no perderlos. Si no aparece esta opción sobreescribe la instalación actual y dile adios a tu configuración (tus datos no aparecerán; sin embargo puedes recuperarlos posteriomente mediante utilidades como el Ontrak disk recovery siempre y cuando NO formatees a bajo nivel)
Que exista un conflicto de instalacion de sistemas operativos y nisiquiera te aparezca el logo del sistema. Generalmente aparecen errores en DLL's
Por cierto, creo que esto va para el foro de mantenimiento...