Te vas a tener que meter con comandos de escritura de bajo nivel (y me refiero a la Int 13h o servicios equivalentes de la 21h).
Editá el sector del boot del disco (con el PCTools si es un disquete o con el HexaEdit, buscalo en la WWW, si es un disco o cosa así). En el primer sector del disco está el nombre y el Nº de serie. Hacé una rutina que posicione la cabeza en ese sector absoluto y reescribí el Nº de serie.
Veo si te averiguo algo más...