Primero debes tener el cursor dentro del campo y a continuación leer el código de barras con cualquier lector.
Algunos lectores, permiten enviar algún carácter de escape antes de la secuencia de código de barras "EAN-13, UPC, etc". Si al campo de FileMaker donde va el código lo ajustas el primero en orden de tabulación y programas el lector para que el carácter que genere previo al barcode sea TAB, ya está.
Salu2