Primero todos todos archivos necesarios de tu app deben de estar en un proyecto excepto las tablas. Las dbs y tablas las puedes excluir del proyecto con el menu contextual que te sale al hacer click derecho sobre el archivo...
Despues debes escoger un archvio principal para tu app.Puede ser un formulario o prg (de los archivos que estan en el proyecto).Haciendo clic k derecho lo estableces como principal
Cierras, el proyecto todos los archivos y incializas el asistente de instalacion, este lo puedes encontrar en este menu item herramientas/asistentes/instalacion. El asistente te llevara paso por paso hasta crear los archivos de instalacion. Ojo este paso solo se lleva acabo con vfp6 o 5 con versiones posteriores ocuaprias manejar el installshield que viene con el vfp. Listo ya tienes los instaladores de tu app.
Checa cmandos como READ EVENT, CLEAR EVENTS, QUIT ON SHUTDOWN para saber como inicializar y cerrar tu EXE correctamente.
En la ayuda del fox viene un capitulo donde podras encontrar mas detalles de como crear tu EXE