Java - Ayuda URGENTE con JAVA!!!

Buenas a todos,

Necesito hacer un programa en JAVA, pero el problema es que la necesito hacer en Java, pero de este lenguaje no se mucho.

Por ejemplo tengo el decompilador de Java DJ Java Decompiler 3.9 necesario para traducir el applet a un archivo entendible por un compilador, el compilador que tengo es el NetBeans 4.1 que es un poco complicado de usar, intento poder editar el modo gráfico del programa pero no puedo. Lo que necesito es tomar como base uno de esos programas editar y basarme en ellos para hacer el mía pero no puedo porque no se mucho de JAVA, y también si hay compilador más fácil de usar.

Los programas que tengo son:

http://lorax.chem.upenn.edu./Education/MB/MBjava.html

aparece cuando se da click en el botón GO, pero no se como conseguir el archivo de este para editarlo, si saben se agradece la ayuda.

http://www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadist...ll/maxwell1.jar
http://www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadist...ell/maxwell.jar
http://www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadist...n/boltzmann.jar
http://www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadist...rnot/carnot.jar

Gracias.