Maria si te entiendo bien lo que tu quieres es inicializar variables, al igual que se hace en la cabecera de un programa en C, verdad?
Bien eso que yo sepa hay dos formas de hacerlo: la forma profesional y la funcional.
FUNCIONAL.
coloca tu variable en true o false desde el panel frontal, despues clica con el secundario del raton y seleciona: Data operations --> make current value default. Con esto, cuando se abra el programa por primera vez, la variable tomará ese valor. Cuidado porque al parar el programa y volverlo a hechar a andar no se reinician las variables. Para asegurarte, debes antes de volver a ejecutar, hacer lo siguiente: en el menu superior "operate --> Reinitialize all to Default"
PROFESIONAL.
Create un archivo .INI, es un file de inicialización que se ejecuta siempre antes de comonzar el VI. Busca en ni.com como hacerlo
SUERTE.