Linux/Unix Shell Scripting - Comparar columnas distintas en Bash

 
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Comparar columnas distintas en Bash

Publicado por Enrique (2 intervenciones) el 27/04/2018 13:50:31
Buenas tardes! Soy un poco nuevo en esto, pero os comento mi problema...

Estoy realizando mi TFG, enfocado en la bioinformática. Tras varios datos obtenidos, me he encontrado con un fichero (en formato .txt) al que hay que quitarle dos columnas y compararlas entre ellas, para que así me indique la diferencia de longitud de caracteres que hay entre ambas.
Es decir, si la fila 1 de la columna 1 mide 7 caracteres, y la columna 2 de la misma fila mide 10 caracteres, que me arroje que el resultado es 3 caracteres (que me de el valor numérico de la diferencia). Si por ejemplo tienen los mismos caracteres, que me diga 0. Y sin embargo, si la fila 1 de la columna 1 mide 10 caracteres, mientras que en la columna 2 mide 7, me indique que hay -3 caracteres.

De momento lo que he conseguido es aislar las dos columnas (son la 4 y la 5) que quiero de la siguiente manera:
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cut -f 4,5 entrada.txt > salida.txt
Necesitaría pues comparar ambas columnas y generar la diferencia que hay en cada fila.

Muchísimas gracias
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Comparar columnas distintas en Bash

Publicado por kip (17 intervenciones) el 27/04/2018 16:17:53
Hola, algo sencillo que se me ocurre es usar awk, algo asi:

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cut -f 4,5 entrada.txt | awk '{print length($1) - length($2)}'
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Publicado por Enrique (2 intervenciones) el 28/04/2018 15:23:39
Es perfecto, muchísimas gracias
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