Has notado si ¿te pasa en cualquier momento? , ya sea inmediatamente de encender la PC, despues de un rato de trabajar o despues de ciertas horas de trabajo o cuando abres alguna aplicacion en especifico, desde mi punto de vista el problema pueden ser 2 cosas:
1. Hardware: El ventilador del cpu quiza ya no enfrie adecuadamente esto generalmente se soluciona con un mantenimiento preventivo, y en caso de que definitivamente no funcione bien el ventilador habra que remplazarlo.
2. Software: Puede ser que algun programa Adware, Malware o incluso un gusano te ocasione este problema para esto debes instalar un programa que elimine este tipo de software te recomiendo que uses spybot (www.spyboy.info) el cual te elimina adware, malware y spyware o Vi Robot (www.hauri.cl) que te elimina todo lo anterior mas virus, gusanos, troyanos, etc. solorecuerda actualizarlos antes de usarlos espero te sirva.
PD. Te sugiero que de preferencia uses Vi Robot comoprimera opcion y spybot como segunda.