Ms-Dos - Crear archivos .bat para desktop

Yo trabajo bajo Windows y UNIX y están en servidores NT y SUN respectivamente, me interesaría crear archivos .bat que se conecten desde windows en NT a UNIX en SUN, para copiar archivos y ejecutar programas desde Windows , pero que están en UNIX, es para que los usuarios no se tengan que conectar a UNIX directamente, sino, que puedan hacer todo esto desde su DESKTOP y le pase transparente lo que está sucediendo en UNIX que es realmente producción. Ej. sería copiar un archivo de fecha desde Windows a UNIX, copiar un archivo de texto desde Windows a UNIX y luego ejecutar un programa desde Windows a UNIX.. Muchas gracias...