MySQL - Query combinando dos base de datos en el mismo servidor

Estimados estoy ejecutando un select el cual combina dos bases de datos alojadas en el mismo servidor. si bien obtengo el resultado deseado, mi inconveniente se encuentra en el tiempo de respuesta a la consulta.
sin duda el problema reside en la coneccion inicial, una vez que se efectuó la coneccion la respuesta es más rápida, pero la consulta inicial es la que tarda demasiado.
¿Alguien tiene una solución a mano? Gracias.