MySQL - crear una base de datos

puedo crear desde una base de datos de mysql en el directorio c: llamada prueba
por ejemplo mysql>create table c: prueba

Tendrias que modificar el path de como se manejan los datos en mysql, por defecto mysql instala todo en un mismo directorio, y cada base de datos está dividida por folders, es decir, la funcion create database no soporta lo que pides y menos aún el create table.

Checa la referencia de Mysql

http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/create-database.html