Netbeans - Error al compilar

Buenas a todos, tengo un problema con mi .jar, mi aplicación consiste en abrir y escribir archivos xml respetando utf-8, todo funciona de maravilla dentro de Netbeans, pero al compilar el .jar y ejecutarlo, al guardar mi archivo, se añade el signo "?" al inicio del mismo, ya revisé el código y no hay ninguna instrucción que indique que haga eso, y ni hablar del .exe porque pasa de la misma manera, pero la aplicación corriendo dentro de Netbeans funciona de forma correcta sin añadir ese signo. Espero puedan ayudarme.