PHP - como agregar descuentos en sistema de facturación

$valor=100;

echo $valor-(($valor*10)/100); // 90

<?php $sql=$conexion->query("SELECT sum(total)as subtotal from carrito_compras") ;

       $fila=$sql->fetch_array();

       $total=$fila['subtotal'];

       $Iva=($total*12)/100;

       $SubTotal=$total-$Iva;

    ?>

$total=$fila['subtotal'];

$total=$total-(($total*$descuentoDelUsuario)/100);

$Iva=($total*12)/100;

$SubTotal=$total+$Iva;