Mira supongamos que en un tu formulario HTML, estos checkbox corresponden a una lista de Hobbies, entonces haces esto:
<inputy type=checkbox name=hobbie[0] value=valor1>HOBBIE 1
<inputy type=checkbox name=hobbie[1] value=valor2>HOBBIE 2
.....
.....
.....
<inputy type=checkbox name=hobbie[n-1] value=valorn-1>HOBBIE N
Entonces la forma de recogerlos en PHP es usando un ciclo FOREACH, debido a que PHP recibe solo los que se chequean, si no se chequea ninguno pues no recibe:......
$i=0;
foreach($hobbie AS $elemento)
{
$escogidos[$i]=$elemento;
$i++;
}
de esta forma en el array $escogido, quedan guadados los valores de cada checkbox seleccionado, la longitud de este array depende obviamente del numero de elementos seleccionados