PHP - Php escanear imagenes

Tengo que hacer un sistema que digitalice documentos y lo relaciones a una serie de datos, ejm una factura y la almacene con un codigo nombre dle cliente, el lenguaje es php5 y la base de datos el mysql, lo que se me ha ocurrido hasta el momento es digitalizar el documento con el programa del scanner y luego con el programa hacer un upload del archivo y cargar los demas dato, Hay alguna forma de usar de que sea mas directo desde el programa a desarrollar.

Gracias