Hola, pues me parece muy raro, no deberia ser asi, eh pasado por SQL Server, SQL Anyeare, Oracle, ultimamente FireBird con ODBC, y ninguna sin problemas, lo que si se es que una version del ODBC de MySQL tiene algunos bugs, no se que version sea la vdd, tendrias que probar diferentes versiones, puesto que si el autocommit esta en false, no deberia de hacer nada hasta que haces el commit manual