QT - Compilar un proyecto

Hola yo estaba haciendo unproyecto en qt 3 en mii linux luego vi la versión4 y lo intente actualizar el proyecto apenas empezaba así que decidí cambiar el proyecto a toda la nueva estructura de la versión 4.1.2, pero cada vez que lo intento compilar con el qmake -o Makefile projecto.pro y luego make, me hace el proyecto para usar las librerías del qt3, por supuesto que esel qmake del 4.1.2y si hago lomsimo en otra carpeta si me lo pone comoproyecto del at 4.1.2 por qué? ¿Qué hago?