Laura,
Creo que una metodologia "SCADA" formal, unica y hasta universal como la planteas no existe, ni siquiera la ISA tiene un documento o estandard para estas aplicaciones. Ellos tiene para procesos Batch (S88), seguridad para sistemas SCADA, interconexion con sistemas ERP (ISA 95) y hasta los codigos de colores para la elaboracion de despliegues pero algo como lo que pides creo que no existe formalmente.
Revisando la internet con Google podras encontrar varios documentos al respecto, hice una busqueda rapida y encontre estos que me parecen buenos:
1) http://www.rosenblueth.mx/InterFAR/Vol1Num1/doc/Vol1Num1-52.htm
2) http://members.iinet.net.au/~ianw/pmp.html
3) http://www.controldraw.co.uk/presentations/Automationmethodology.pdf
4) http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?tp=&arnumber=637791&isnumber=13841
Espero te sirvan el algo.
Saludos desde Venezuela.