SQL - AL clonar un SSD a otro se me banjan los servicios de SQL y no funciona luego en ninguno

Hola Tengo un equipo con SSD que tiene un sistema contable que ahora da el error de restauracion automatica
que no se repara, el bucle , hasta que opte por clonar el SSD y funciono ahora levantan windows ambos Discos pero el SQL y el programa no funcionan .
La pregunta es que tegno que hacer antes de clonar el SSD para que no se malogre en ambos discos, tendia que detener los servicios o algun paso para que no me suceda esto
Si alguien podria darme una ayuda sobre este tema le agradeceria . gracias

Probaste con Acronis?
Como "clonaste" el SSD?