SQL - Introducir consulta en javascript

Buenos dias:

Llevo varios dias comiendome la cabeza con un problema. Tengo esta funcion:

<SCRIPT>

function confirmation()
{

var answer = confirm("¿Desea....?")
if (answer)
{

$sql2 = "UPDATE plantilla SET transferible='SI' WHERE cod_jugador='$id'";
$res = mysql_query($sql2) or die ("MySQL Problem : " . mysql_error());

}
}
</SCRIPT>

Este codigo esta metido en un archivo .php y me da error por hacer el update ahi y he probado distintas posibilidades y nada. Me gustaria que alguien me dijese si sabe como al pulsar el boton que ejecuta el confirm se ejecute la actualizacion.

Muchas gracias.