TeX/Latex - Hacer in libro en latex

Hola, tenemos una duda muy grande. Estamos haciendo material para una clase, pero resultó ser mucho. El problema es que latex nos compila bien la primera vez, pero no la segunda cuando pone las etiquetas. Ah, otra cosa, también nos dimos cuenta que esto ocurre cuando hacemos el documento tipo book y agregamos chapter. Gracias por su respuesta