Tomcat - Rutas Relativas

Necesito leer un fichero desde un servlet y poniendo la ruta asi me falla
./directorio/archivo.xml , he visto que ./ me manda a C://windows/system32 y si solo pongo la / me manda a C:/ directamente.

Mi archivo xml podria estar en cualquier parte del Servidor Tomcat, pero necesito acceder a el de esta forma que si me funciona en WebLogic:
File file=new File("./directorio/archivo.xml");