Visual Basic para Aplicaciones - (AUXILIO) Ejecutar comando en MS-DOS

En estos momentos estoy haciendo una aplicacion en visual pero esta tiene que llamar a un comando en MS-DOS para ejecutarlo y luego ese comando te solicita una tecla de "Y" (YES) para confirmar (algo como FORMAT A: y luego me pide la tecla enter para confirmar).
El problema que tengo es que cuando ejecuto la instruccion con Shell esta corre sin problemas pero cuando le trato de enviar una tecla "Y"
con SendKey esta no se activa y creo que es por que esta instruccion (SendKey) no funciona en MS-DOS.
Agradecere mucho quien me pueda ayudar.