Si son comandos externos no vas a tener problemas. Osea, los comandos externos son todos aquellos que los encontras en forma de ejecutable por ejemplo format.com, en cambio con los comandos que son internos, osea que se cargan en la memoria de la PC cuando inicia el sistema operativo (por ejemplo dir, tree, etc) no podés llamarlos desde el visual a no ser que uses apis de windows o algún interprete.
te recomiendo que entes a www.somser.com, en la parte de apis y veas si hay algo de lo que vos querés ejecutar. caso contrario decime que es lo que querés hacer y veo si te puedo ayudar.
afogutu.