En realidad no se puede (por lo menos que yo sepa) cambiar el color de toda la colúmna con una sola instrucción.
La manera de obtenerlo es conforme vas llenando datos, entonces le vas poniendo el fondo o el color de letra. ej. form1.MSFlexGrid1.CellBackColor =qbcolor(12)
El codigo seria el siguiente
with msflexgrid1
.col = n ' n es la columna que quieres cambiar el color
For i = 1 To .rows - 1
.row = i
.CellBackColor = RGB(255, 255, 255)
.CellForeColor = RGB(0, 0, 0)
Next i
end with