Visual Basic - Grabe Problema con Declaraciones

Acabo de terminar mi programa y tengo un grabe problema con una declaracione que solo existe de windows 2000 en adelante....
Si, la misma que estás pensando, "SetLayeredWindowAttributes".

Bueno lo que yo quiero hacer es que el programa declare esta función solo si se está en un sistema >= Windows 2000...
¿Como lo hago?
¿Tendré que nesesariamente hacer un programa para WIN2000 y otro para WIN9x?

Puedes utilizar directivas del preprocesador, en una constante defines la versión del sistema operativo y luego según se cumpla la condición declaras o no esa función, en la MSDN tienes éste ejemplo:

If Mac evaluates as true, do the statements following the #If.
#If Mac Then
'. Place exclusively Mac statements here.
'.
'.
' Otherwise, if it is a 32-bit Windows program, do this:
#ElseIf Win32 Then
'. Place exclusively 32-bit Windows statements here.
'.
'.
' Otherwise, if it is neither, do this:
#Else
'. Place other platform statements here.
'.
'.
#End If

Para la versión del sistema operativo, puedes ver en: http://www.experts-exchange.com/Programming/Programming_Languages/Visual_Basic/Q_11485659.html

No puedo declarar Yo una constate para luego comprobar... ej:
Me arroja el error: Se debe declarar una expresión Constante

no entendi bien, lo que quieres, compilacion condicional ?
o no usar una funcion si estas en sistemas 95/98/me/nt

puedes hacer esto, carda la dll en tiempo de ejecucion, y luego tratas de sacar el puntero a la funcion, si no existe la funcion retornara cero.