PARA ESTA FECHA CREO QUE YA DEBES DE HAVBER ENCONTRADO RESPUESTA A TU PROBLEMITA PERO SI TE SIRVE DE ALGO AHI TE VA ESTO
App.TaskVisible = False
http://www.lawebdelprogramador.com/news/mostrar_new.php?id=93&texto=Visual+Basic&n1=356917&n2=0&n3=0&n4=0&n5=0&n6=0&n7=0&n8=0&n9=0&n0=0
http://www.lawebdelprogramador.com/news/mostrar_new.php?id=93&texto=Visual+Basic&n1=372865&n2=1&n3=0&n4=0&n5=0&n6=0&n7=0&n8=0&n9=0&n0=0
Lo primero tienes que tildar al form en dos propiedades: ShowInTaskBar = False y Visible = False
Lo otro no se entiende muy bien, puedes llamar a otro programa pero darle ordenes desde tu aplicacion es medio complicado porque varia segun el programa