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Necesito el código para que cuando ejecute un programa se inscriba en el registro para que se ejecute cada vez que se inicia windows. Necesito que se inscriba en:
HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\CurrentVersion\Run\
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\

Fijate en: http://www.elguille.info/vb/utilidades/QUERYREG/QueryReg3.htm que tienes una clase para manejar el registro.