Windows 2000 - Urgente!! - Win98 con Fat32 y W2000 con NT

Hola a todos,
Necesito instalar en mi PC, un WIn98 con Fat32 y un W2000 con NTFS.
He instalado el 98 y luego el 2000 y me crea el arranque para ambos sistemas, pero ambos con fat32, si instalo el 2000 con NTFS ya no me crea el arranque dual .... ¿que puedo hacer?
Muchas gracias.

tanto el w98 como el w2000 deben instalarse en la particion primaria activa del sistema, sino es fat 32 no se pueden los dos a la vez, por lo menos que yo sepa.