Los favoritos son accesos directos a url(*.url), Seguramente los encontraras en \Windows\Favoritos o \Windows\Favorites. Para saber donde se encuentran haz click:
Inicio\Favoritos\
y botón secundario en cualquier enlace (no carpeta)- Propiedades y en la pestaña general te dice la ubicacion, ahora lo que tienes que hacer es copiar todo el contenido de esa carpeta en la carpeta de favoritos de la otra pc, podrias empacarlo en un .zip que te guarde el path y asi tendrias una copia identica.
No creo que te queden dudas.