Windows Server - borro archivos y al reiniciar siguen

Hola tengo varios ordenadores conectados a win2000 Server y cada vez que borro algo y despues reinicio el equipo, me vuelven a salir, con el riesgo que tiene esta operación. Por favor me gustaría que me informaráis cual es la configuración en perfiles locales que tengo que cambiar para solucionar este problema.