Esos ficheros indican a tu sistema operativo que contenido tiene cada actualización de Windows. Cada vez que actualizas el sistema operativo, creas un directorio NtUninstall que dice al sistema que cosas quedaron obsoletas.
En caso de que necesites desinstalar una actualización, ese fichero le dirá al sistema que es lo que había antes.
Para la mayoría de los mortales la actualización KB885250 nos dice poco, y es muy posible que no la desinstalemos nunca.
He encontrado una página en inglés donde puedes bajarte un programa que elimina aquellos NtUninstall que ya no sirven, con lo cual puedes limpiar parte de tu disco.
La página es: http://www.askdavetaylor.com/can_i_delete_the_contents_of_windows_ntuninstall.html y la aplicación se llama: XP REmove Hotfix Back-up
