RE:Como pudeo instalar...
Agradezco el concepto Jazmin...
Respondiendo la pregunta: el problema con Win98 es que solo se instala en la primera partición del primer disco rígido. SI tienes un solo disco rígido me temo que tendrás que deshacerte de Windows 2000 temporalmente, instalar Windows 98 en la primera partición y luego reinstalar Windows 2000 en la segunda, si lo haces de esa manera aprovechas que Windows 2000 te instala el bootmanager que de dará a elegir entre un SO y el otro para arrancar.
Si tienes dos discos rígidos cambia el orden de booteo en la BIOS para que el disco sin SO sea el primero y Windows 98 se instale allí.