Tony, seguramente tendrás algún error o varios errores de código en alguna parte de la aplicación y por eso no te permite convertir a MDE. Entra en el editor de VBA de cualquier formulario o Módulo y en el Menú "Depuración", pulsa en "Compilar ......" y te irán apareciento marcadas en color amarillo las líneas de código donde están los errores. A veces esas líneas que marcan error, ni siquiera son necesarias pués pueden ser "basura" como consecuencia de pruebas, botones de comando que hemos eliminado, Eventos sin conexión, etc.
Cuando consigas que al depurar no aparezca ningún error, ya podrás convertir a MDE.
Saludos
Enrique