Bueno gaby, primero, asumire que te refieres a SQL Sysbase, el que despues se convertiria en Microsoft SQL Server 6/7/2000.
Creo que la principal diferencia radica en que Access es una base de datos "Desktop", osease, para aplicaciones sencillas, no en el termino literal de la palabra. Esto es, Access es una base de datos para usuarios y, en este caso en particular, que se puede emplear junto con Office. Por eso, encontraras tipos de datos que no son estandares (como el currency), e incluso su SQL difiere del estandard (considerando lo mas estandard posible el SQL ODBC). Asi, Access no responde a los tradicionales Create / Alt Trigger... y no maneja Stored procedures.
Sysbase es lo contrario; es mas estandard y no es "desktop".
Al final de cuentas, para saber cual emplear, necesitarias basarte en "vas a emplear los aditamentos extras de Sysbase (stored procedures, triggers, jobs...)? y es muy grande la base de datos?
Si alguna de las respuestas a las preguntas anteriores es "si", entonces utiliza Sysbase. Caso contrario, Access: es mas barato.
Por ultimo, quizas te gustaria considerar algunas otras opciones en bases de datos Desktop mas estandares (o personalizables) como DBase o FoxPro (en particular, Visual Fox Pro 7 tiene buen soporte).